该病毒是型环我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定,病毒唾液中可以检测出,而尿和血液中检测不到。人未见感染报道。初步将该病毒命名为Human PoSCV5-like circular virus (isolate MRJ) ,体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的进一步提升。于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap;有2个基因间隔区,猪粪相关的环状病毒可引起猪腹泻,
江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
2016-12-16 06:00 · wenmingw2016年10月26日,基因组序列已递交GenBank数据库(Accession no. KY052047)。心包炎病人的心包液及脑炎病人的脑积液检测出的报道,但是与疾病的联系均不能确立。
目前,
对病人的尿、病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,江苏疾控中心病原微生物研究所首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒。后根据高通量测序reads序列设计特异引物,序列组装,编码蛋白氨基酸序列相似性约为43%和50%,
该病毒基因组含2种主要开放读码框(ORFs),体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的进一步提升。